Redacción
Un equipo multinacional y multidisciplinar de investigadores ha analizado muestras de virus y bacterias recogidas en transportes públicos y centros hospitalarios de más de 60 ciudades de todo el mundo.
Como concluyen en su trabajo publicado en Cell, cada ciudad tiene su propio microbioma, a modo de huella digital de virus y bacterias que la identifican de forma única.
Este trabajo se considera como el estudio metagenómico global más grande de microbiomas urbanos, que abarca tanto el aire como las superficies de varias ciudades.
Presenta un análisis completo de todas las especies microbianas identificadas, incluidos miles de virus y bacterias y dos organismos unicelulares recientemente identificados que no se encuentran en las bases de datos de referencia.
La profesora Lynn Schriml, del Departamento de Epidemiología y Salud Pública del Instituto de Ciencias del Genoma (IGS), de la Universidad de Maryland (EE UU), dirigió el muestreo del estudio para los sistemas de transporte urbano de Baltimore.
La firma microbiana distintiva de Baltimore revela un mundo único, fascinante y diverso, que proporciona información sobre la variación geográfica y los genomas microbianos previamente desconocidos
El autor principal del estudio, el profesor Christopher Mason, de Weill Cornell Medicine y director de la Iniciativa WorldQuant para la Predicción Cuantitativa, explica que “cada ciudad tiene su propio eco molecular de los microbios que la definen. Si me diera su zapato, podría decirle con un 90% de precisión la ciudad del mundo de donde viene”.
Este consorcio internacional lanzó el proyecto MetaCOV en 2020, para investigar el cambio en los metagenomas urbanos y aislar virus y bacterias de entornos urbanos como cajeros automáticos, aguas residuales, hospitales y sistemas de transporte, entre otros.
Los hallazgos de la última investigación se basan en un análisis de 4.728 muestras de ciudades de seis continentes, tomadas durante tres años, y representan el primer catálogo mundial sistemático del ecosistema microbiano urbano.
Además de las distintas firmas microbianas en varias ciudades, el análisis reveló un conjunto básico de 31 especies de virus y bacterias que se encontraron en el 97% de las muestras en las áreas urbanas muestreadas.
Los investigadores identificaron un total de 4.246 especies conocidas de microorganismos urbanos, pero también encontraron que cualquier muestreo posterior probablemente continuará descubriendo especies que nunca antes se habían visto, lo que destaca el potencial bruto de hallazgos relacionados con la diversidad microbiana y las funciones biológicas en los entornos urbanos.
El consorcio MetaSUB se ha ampliado desde entonces para incluir proyectos que muestren diversos entornos, como alcantarillas, monumentos y hospitales, con el doctor Schriml muestreando biopelículas en el Monumento Orpheus, en Fort McHenry, y en el Monumento Nacional de los Soldados en Gettysburg, en 2018.
